经现代高科技探测，在孝陵宝鼎的下面有一个面积宏大的空间，而且还有一条长长的通道直通明楼东侧十几米处，有一片下沉的地方，就是现在有裂口的堡城，城墙之下，不过这也不能足以证明朱元璋就在这里，朱元璋究竟在哪里，恐怕还要相当一段的时间才能证明。埋葬的是朱元璋祖父、曾祖父与高祖父的遗物，俗称衣冠冢。
1、朱元璋的墓在哪里？
朱元璋是明朝的开国皇帝，从放牛娃到权利顶端把一个四分五裂的国家收复统一，再到加强中央集权，对贪官实行史上最严厉的惩罚，朱元璋的所作所为都值得后人深思。朱元璋的陵墓究竟在哪里？朱元璋的少年时期过得十分艰难，早年他给地主放牛补贴家用，但是他的父母在不久之后因瘟疫去世，他和哥哥死里逃生之后才发现，他们不仅连父母买棺材的钱也没有，而且也没有可以下葬的地方，
为了不拖累哥哥，朱元璋决定让哥哥带着侄子和嫂子走，自己一人逃生不做累赘。后来他当过和尚要过饭，看尽了世间百态，力尽的艰难，后来当上了皇帝，也许就是印证了那句，天将降大任于斯人也，必先苦其心智。朱元璋除了经历比较坎坷之外，还有一件事情被人津津乐道，就是他死前曾经留下了谜团，1398年，朱元璋病逝，享年七十一岁！朱元璋死后也有很多谜团！第一个谜团首先就是朱元璋只匆匆下葬，要知道古代皇帝死后并不是马上就要下葬的，而是要做好充足的准备，毕竟葬礼越隆重越能彰显出地位。
但是朱元璋并没有这样，反而在生前就命令朱允炆自己死了以后要在七天内下葬，不必等别人回来，导致他下葬的时候许多皇子皇孙都还在路上没能赶回来！第二个谜团也就是出葬的时候有13支队伍，朱元璋生性多疑，连出殡也很特别，为了防止敌人看出来他的下葬位置，朱元璋也做足了功夫，他下葬时有13支一模一样的队伍一起出发，没有人能知道那一只是真的，就连抬棺木的人也不知道，也许朱元璋知道自己杀了太多人树敌太多，为了躲避仇家或者猖狂的盗墓贼，朱元璋选择了这种做法，以保证死后能够安眠。
南京过去有个民谣，南京有三怪；龙潭的姑娘像老太，萝卜当做小菜卖，13个城门抬棺材！虽然说有13口棺材，但是没有不透风的墙，随后不久就传出朱元璋真身葬在城西的朝天宫内，有人说朱元璋就埋在那里，明孝陵处于山清水绣的环境之中，周围山势跌宕起伏，山水环绕，人文与自然景观浑然天成，人员规模宏大，格局严谨，孝陵建筑宝成纵深2.62公里，陵寝主体建筑当年建有红墙围绕，周长2.25公里。
以上说的只是陵园的地上结构而已，地宫的实际面积与构造至今没有进行明确的考古勘探，初步探测应该为石材构筑的大型殿室地下建筑，地宫建筑面积根据探测几乎是以发掘定陵地宫面积的三倍，也就是说到现在为止还不知道朱元璋的棺椁到底埋葬哪里，明孝陵以前虽然也有盗墓贼出入，但始终没有找到棺椁之处，考古人员在明孝陵宝顶高高的堆土之下发现了厚厚一层圆润的鹅卵石，这类似于古代的一种流沙防盗法。
当盗墓贼挖开一个盗洞的时候，鹅卵石就会从四面八方滚落下来，把洞填满，这也是现在连盗掘的痕迹都很难找到的原因，这一种说法还没有被证实。忽然就传出另外一种说法，说朱元璋既不在孝陵也不在朝天宫，而是对其四次朱棣偷偷的运到了北京的万岁山，不过这一种说法也被人否定过，原因是万岁山凤以子公不远，数千里而往之时。也就是说，如果朱元璋真的埋在了北京，那么朱棣造反就找不到理由了，如此说来说去，朱元璋究竟埋在哪里？经现代高科技探测，在孝陵宝鼎的下面有一个面积宏大的空间，而且还有一条长长的通道直通明楼东侧十几米处，有一片下沉的地方，就是现在有裂口的堡城，城墙之下，不过这也不能足以证明朱元璋就在这里，朱元璋究竟在哪里，恐怕还要相当一段的时间才能证明！，
2、朱元璋的后代有葬在凤阳的吗？
明祖陵是明朝开国皇帝朱元璋于1385年（洪武十八年）为其高祖（玄皇帝）、曾祖（恒皇帝）和祖父（裕皇帝）三代修建的衣冠冢，这里亦是其祖父朱初一的实际埋葬地，位于泗州城北杨家墩，即今江苏省淮安市盱眙县境内，淮河以北的洪泽湖畔。清代康熙年间被洪泽湖淹没，直到1966年洪泽湖的枯水季节方又露出水面，1976年进行了初步的整理发掘，1980年，国家文物局、江苏省文化厅拨款进行修复。
