偶尔的进入水中生活后，由于当时水中的竞争者较少，食物较多，而且在岸边当时有大量的陆行性动物活动，也有利于它们的偷袭。所以，从陆行鲸开始，古鲸在水中生存的时间开始逐渐的变长。到了距今约4000万年前，已经高度适应水下生活的陆行鲸发生了极大的变化，此时它们的前肢开始退化，后肢逐渐演化成了鳍状足，尾部也逐渐的由结缔组织变为水平尾叶。
这时，一种新的鲸出现了，它就是罗德候鲸。完全适应了水中生活之后，古鲸们通过四通八达的海洋来到了世界各地的海域中，开始了漫长的独立演化，最终形成了由98种鲸组成的现存鲸目。那么，从鲸的演化中我们找到了什么答案呢？首先，鲸类的演化是从陆地上先开始的，而且古鲸曾经半水半陆的生存了几百万年，在这个过程中，还能在陆地上行走的古鲸，靠的就是“狗刨式”在水中行走。
慢慢地，随着四肢的退化以及尾部的变化，它们才完全适应了水下的生活，而在这个过程中，古鲸都是在潜水层生存的，它们的口鼻时常的能够露出水面用来呼吸。就这样，鲸类完成了演化，所以，在鲸类的演化史中，呼吸并没有成为演化的阻力，反而经常的出水面透气，是它们必须要做的事情，因此也就没有必要再单独演化一套别的呼吸系统。
随着鲸类完全适应了水下生活，鲸类的呼吸器官鼻子开始向更靠近水面的顶部移动，形成了“喷水孔”，这让鲸即使不用把头部露出水面也能够自由的呼吸。除此之外，鲸本身就是哺乳动物，哺乳动物从形成就已经选择了用肺呼吸，而鱼类它们从开始就是用鳃呼吸的，所以，即使鲸的生存环境发生了改变，呼吸系统也不可能变异成为另一套呼吸系统，而且哺乳动物压根就没有可以演化出鳃这种器官的原器官。
所以，即使鲸为了很好地在水中生存，趋同演化出了鱼的形态，也不可能改变自己的重要器官和特征，比如生殖方式、喂养后代的方式（哺乳）以及呼吸方式。其次，鲸类在海洋中并没有鱼类的鱼鳔这种可以控制身体上升或者下潜的器官， 那么，它们怎么才能控制在水中的上升和下降，所以它们就需要一个强大的肺，至少是比较大的肺，通过装满空气以及挤压肺部的方式来让自己上升和下降。
所以，对于鲸来说，在水中生存，肺也是极其重要的，而哺乳动物的肺就是呼吸器官，这个器官的必要存在性，就注定了鲸不会演化出水下呼吸的能力。总结鲸不是鱼，它虽然在水中生存，但也是由陆生的哺乳动物逐渐的演化而来的，这就意味着鲸是不存在鱼鳔这个器官的，而想要在水中生存，必须有一个可以替代鱼鳔的器官，那就只能是肺了，所以肺对于鲸来说是不可能消失的，而肺作为哺乳动物的呼吸器官，不消失就意味着呼吸方式不会发生改变。
鲸鱼有没有嗅觉、味觉？为何鲸鱼在长久的进化中还要定时浮出水面换气？
鲸鱼的祖先是陆生动物，它现存最近的亲戚是河马。生活于5000万年前的走鲸（Ambulocetus）：海豚的嗅觉已经高度退化（海豚属于鲸目，是的），我想鲸类的嗅觉应该都是很差的，因为它们基本没有使用嗅觉的机会，它们的活动基本都是在闭气的状态下进行，嗅觉对它们的生存和繁殖不再有作用。不用鳃，除了这一器官进化本身的困难以外，哺乳动物是温血，需要很多的氧气，水里的氧气太少，只能满足鱼这样的冷血动物。
据国外《ScienceNOW》杂志的一份最新研究报告称，鲸鱼和海豚已经失去了品尝其它味道的能力，仅有咸味被保留了下来。科学家对15种不同海洋生物的基因组进行了分析，他们的研究对象中包含须鲸、抹香鲸和宽吻海豚。这项最新研究发现，这些海洋动物与味觉相关的大部分基因都出现了突变，而且无法产生品尝味道所必需的蛋白质。
只有与咸味相关的基因保留了正常功能。研究团队称，这些突变很可能出现在大约5300万年以前，而这些突变的出现很可能是因为这些动物整个吞下它们的猎物，而且不需要品尝味道，而味道只有在咀嚼的时候才会释放出来。通常食物的味道能够让动物了解这种食物是否有营养或者有毒。鲸类动物已经失去这种认知的能力，而且以某种方法存活了长达数百万年的时间。
然而，研究的作者所关心的是，人造有毒物质有可能已经在鲸类动物无法察觉的情况下进入到它们的饮食当中。比如说，逆戟鲸曾经游入到原油泄漏区，福罗里达州沿岸的肥料会进入宽吻海豚捕食的鱼类体内等。鲸鱼在水中不呼吸，它们总是在需要换气之前先浮到水面上，然后换气。至于那个水柱嘛，那是因为鲸鱼外鼻孔只有1个，因此呼吸换气时只能喷出一股水柱（呼气时，空气中的湿气会凝结而形成我们所熟悉的喷泉状）。
